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《菌物学报》是1982年创办的中文学术期刊，曾用名《真菌学报》，月刊，中国科学院主管，中国科学院微生物研究所、中国菌物学会主办。

学报主要刊登菌物系统分类学、菌物分子与细胞生物学、菌物区系地理学、菌物多样性及资源开发利用、动植物病原菌物学、医学真菌学、食用和药用真菌学等方面的研究论文。

根据2018年5月学报官网显示，《菌物学报》编委会拥有顾问4名、编委38名及外籍编委6名。根据2018年5月1日中国知网显示，《菌物学报》总被下载623470次、总被引43748次，（2017版）复合影响因子为1.405、（2017版）综合影响因子为1.045。根据2018年5月1日万方数据知识服务平台显示，《菌物学报》载文量为2462，被引量为24129，下载量为43135。2015年期刊在全部统计源期刊（6735种）中排名第715名，在生物科学（93种）中排名第11名；2015年期刊影响因子为1.19。

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